“交我算”助力分子动力学能量稳定格式开发：突破能量漂移难题
导读分子动力学模拟是研究微纳尺度系统结构和动力学性质的关键工具，被广泛应用于软物质、生物化学和能源材料等前沿领域。然而，长程库仑力的计算成本高昂且易引发能量漂移，严重制约了分子动力学的模拟精度与效率。上海交通大学快速算法与高性能计算实验室徐
2024-12-26
平台致谢
“交我算”助力胃肿瘤泛基因组研究
引言泛基因组学研究将有望提高人类参考基因组（GRCh38）的完整性并促进精准医学。上海交通大学生命科学技术学院韦朝春教授课题组、上海交通大学医学院附属瑞金医院于颖彦教授课题组、朱正纲教授课题组等多家单位联合完成了汉族人胃肿瘤泛基因组研究，相
2024-12-17
“交我算”助力揭示高效失活CRISPR-Cas系统的新机制
导读CRISPR-Cas系统是细菌和古菌中广泛存在的一种适应性免疫机制，为宿主提供了抵御外来遗传物质的重要防御手段。然而，研究表明，CRISPR-Cas系统在发挥免疫功能的同时，也可能阻碍细菌对外源有益基因的获取，从而在进化过程中引发适应性
2024-12-17
“交我算”助力揭示嗜热Argonaute蛋白的DNA剪辑机制
导读嗜热Argonaute（Ago）蛋白以其高效的DNA剪切活性引起了广泛关注，其独特的动力学行为在基因编辑和分子诊断中具有重要意义。然而，这些高效活性的微观机制尚未完全揭示。上海交通大学洪亮课题组与冯雁课题组合作，利用分子动力学模拟和多种
2024-12-17
“交我算”助力揭示蛋白质动力学随时间变慢的奇异现象
导读蛋白质分子的内部运动是实现其生物功能的基础，然而其动力学行为是否具备一致性却一直是科学界的未解之谜。上海交通大学自然科学研究院和物理与天文学院洪亮教授课题组于2022年在英国皇家化学学会期刊《Chemical Science》上发表研究
2024-12-17
“交我算”助力水系有机靶向液流电池电位预测研究
导读能源安全、温室气体排放和空气污染已成为可持续发展面临的最紧迫挑战。可再生能源是应对这些挑战的有效解决方案，但其不可控的波动性和随机性会造成电网不稳定和严重的电力浪费。液流电池（RFB）因其能量与功率解耦、高可扩展性、设计灵活性和长周期循
2024-12-15
“交我算”助力材料学院朱申敏团队研发新型光电极材料
导读鉴于当前对清洁能源的巨大需求，光电化学水分解产氢技术近年来已成为备受关注的技术。在这一过程中，半导体和液体界面的优化对于提升光电极的活性和稳定性至关重要。 上海交通大学材料学院教学副院长朱申敏教授课题组于2024年4月在材料领域顶级期刊
2024-12-15
“交我算”平台助力异质金刚石结构中的声子热传输研究
导读声子热传输在超硬材料中的表现对于理解和开发具有高导热性的材料至关重要。上海交通大学中英低碳学院的鞠生宏副教授课题组在国际金属材料领域顶刊《Acta Materialia》发表题为“Heterogeneous C–C bonding in
2024-12-15
“交我算” 助力各向异性氧化机制提升MoAlB抗氧化性能研究
导读MoAlB被认为是MAB相族中最有希望的抗氧化材料。上海交通大学机械与动力工程学院及材料科学与工程学院双聘倪娜副教授团队依托“交我算”平台的计算资源，首次系统地通过理论计算探索了MoAlB的各向异性氧化机制，并在此基础上识别出一种有效的
2024-12-15
“交我算”助力热电材料研究取得新进展
导读在能源转换材料领域，热电材料的研究一直是科学家们关注的热点。近期，上海交通大学材料科学与工程学院与中国科学院上海硅酸盐研究所、东莞散裂中子源科学中心、上海高压科学技术研究中心合作，在p型AB2Sb2化合物的能带结构调控和热电性能优化方面
2024-12-15
“交我算”助力脱铝Beta沸石逆Ostwald熟化，耐用铜纳米颗粒催化剂研究
导读铜基催化剂在工业应用中面临的一个关键问题，金属纳米颗粒（NPs）在高温反应条件下的烧结现象，烧结导致颗粒增大，减少了表面积和活性位点，从而降低了催化剂的性能并最终导致不可逆失活。刘露杰，王亮，肖丰收，曹霄鸣等在Science上发文，提出
2024-12-15
"交我算"助力基于神经网络的实时磁共振成像方法的开发
导读实时引导和可视化是机器人辅助手术的关键，计算机断层扫描成像（CT），超声成像以及磁共振成像（MRI）已被应用于机器人辅助的神经外科手术中。MRI无电离辐射，具有良好的软组织对比度，是引导神经外科手术的理想成像模态。但其相对较慢的成像速度
2024-12-15
“交我算”助力糖尿病患者的肠道菌群研究
导读远端对称性多发性神经病变（DSPN）是糖尿病患者最常见的神经病变，约有一半的糖尿病患者会受到 DSPN 的影响，包括Ⅰ型和Ⅱ型糖尿病。2023年7月，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室张晨虹研究员团队与上海交通大学生
2024-12-15
“交我算” 助力洪亮团队发表蛋白质Pro-PRIME模型
导读近日，上海交通大学洪亮教授领衔的联合科研团队，在Science子刊《Science Advances》杂志上发布了突破性研究成果——Pro-PRIME模型。该模型通过自建预训练模型实现零样本预测和小样本微调方法，在蛋白质功能优化领域实现
2024-12-15
“交我算”助力肿瘤临床试验独立阅片
导读使用AI辅助肿瘤阅片具有重要意义。近日，上海交通大学生命科学技术学院俞章盛教授团队与国际药企合作，在Nature子刊《npj precision oncology》上在线发表题为“Deep learning for oncologic
2024-12-15
“交我算”助力Mg-Y-Nd合金析出相演化机理研究
导读在Mg-Y-Nd等沉淀强化镁合金中，其主要强化析出相β1和β′常常形成耦合结构，其中β′析出物附着在β1的两端，呈哑铃状结构。核心问题是，随时效时间延长，当β1在沿其惯习面生长时，附着的β′析出物如何演变。近日，上海交通大学材料科学与工
2024-12-15
“交我算”助力发现前列腺癌代谢干预机制及诊断标志物
导读前列腺癌（PCa）是一种在男性中常见的恶性肿瘤，其发病率和死亡率在全球范围内存在显著的地理和种族差异。尽管前列腺癌的基因组和疾病进展存在明显的异质性，但针对中国患者的局部高危前列腺癌的蛋白质组学特征尚不清楚。2024年9月，上海交通大学
2024-12-15
“交我算” 助力洪亮团队基于图扩散概率模型生成复杂蛋白质全新序列研究
导言人工智能在生物科学中的应用一直备受关注。近日，上海交通大学自然科学研究院/物理与天文学院/张江高等研究院/药学院洪亮团队周冰心研究员设计了一种扩散概率模型框架（CPDiffusion），基于该模型成功设计并生成了具有增强活性的人工程序化
2024-12-15
思源一号助力解析灵长类基因组复杂结构区域
导 读“人类独特性的来源以及人类疾病的产生”一直以来都是备受关注的科学问题。2024年2月29日，上海交通大学Bio-X研究院毛亚飞课题组在学术期刊Cell上发表了题为“Structurally divergent and recurr
2024-09-06
“交我算”助力开发链霉菌全细胞生物传感器
导 读目前细菌耐药性问题日益严峻，同时新药开发周期长、重复发现、效率低等困境愈发显著，因而微生物新颖活性天然产物高效筛选方法的开发受到极大关注。近日，上海交大微生物代谢国家重点实验室邓子新团队康前进研究小组在国际权威期刊《Biosensor
2024-09-06