“交我算”助力陈海峰与冯雁团队探索全新蛋白质序列设计方法
导读蛋白质设计是几乎所有蛋白质工程问题的核心，因为它可以实现具有全新生物学功能的蛋白质的创造，并能够提高酶的催化效率等。2024年3月31日，上海交通大学生命科学技术学院陈海峰教授课题组与冯雁教授课题组合作在中科院Top期刊《Briefin
2024-09-06
平台致谢
“交我算”助力李志勇课题组揭示海绵共生微生物群系对海洋酸化与升温响应的分子机制
导读在全球气候变暖与海洋酸化背景下，研究海绵共生微生物群系对海洋酸化、升温以及同时酸化-升温响应的分子机制意义重大，更有助于海洋保护策略与管理措施的制定。近期，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室李志勇教授课题组在生物学1
2024-09-06
“交我算”助力人工智能蛋白质设计革新
导读利用人工智能构建指导蛋白质定向进化是生命科学领域当前的研究热点。今日，上海交通大学自然科学研究院/物理与天文学院/张江高等研究院洪亮课题组在美国化学学会出版社下Journal of Chemical Information and Mo
2024-09-06
“交我算”助力纳米尺度下热输运的调控研究
导读随着微电子和纳米电子技术的发展，如何有效散热、提高热传导效率、控制热传输成为了一个重大挑战。近日，上海交通大学溥渊未来技术学院鲍华教授团队在国际知名学术期刊《自然通讯》（Nature Communications）上发表了题为“Defe
2024-09-06
“交我算”助力上海血液学研究所细胞淋巴瘤相关抗代谢药物研究
导 读自然杀伤性 T 细胞淋巴瘤（NKTCL）具有高度侵袭性，晚期患者对强化化疗反应不佳。2024年3月，上海血液学研究所赵维莅教授在Nature子刊《Signal Transduction and Targeted Therapy》杂志发
2024-09-06
“交我算”助力新型凝胶电解质和固态钠电池电解质研究
导 读由于锂资源的稀缺性和锂价格的波动，钠离子电池（SIBs）受到了广泛关注。尽管SIBs在低温和高倍率下性能较好，但其能量密度相对较低。为了提高能量密度，研究人员提出了使用钠金属作为负极的钠金属电池（SMBs），并通过构建聚合物电解质来降
2024-09-06
“交我算”助力解析AML的原发耐药机制
导读急性髓细胞白血病（AML）是一种以未成熟髓系前体克隆扩增为特征的异质性恶性肿瘤，“3+7”强诱导化疗仍是年轻AML患者的一线标准治疗方案，但10%-40%的患者会出现原发难治，预后不良，并且其耐药机制尚不完全清楚。2024年2月，上海血
2024-09-06
“交我算”助力基于肿瘤微环境分析的癌症生存预后新策略研究
导读✦•✦癌症患者的预后预测一直是临床中的重要挑战。近日，上海交通大学生命科学技术学院/医学院临床研究中心俞章盛教授课题组与合作者在Cell子刊《Cell Reports Medicine》在线发表题为“Harnessing TME dep
2024-09-06
“交我算”助力开发基于纳米孔RNA直接测序的可迁移深度学习框架鉴定多种类型的RNA化学修饰
导读自然界中存在160种以上的RNA修饰类型，研究表明RNA修饰具有重要的生物学功能，然而如何在同一条mRNA转录本中同时鉴定多种不同类型的修饰位点还存在巨大挑战。近日，上海交通大学生命科学技术学院余祥长聘教轨副教授课题组和上海辰山植物园杨
2024-09-06
“交我算” 助力复材栓接结构装配性能分析研究
导读预测复合材料螺栓连接结构在装配中产生的应力场，对提高航空航天和船舶海洋的装备结构质量是一项有益的工作。然而，应力场的分布是一种复杂的现象，直接采用实验数据进行模型构建需要有极大的材料成本。传统的有限元数分析方法可以模拟应力场分布，但在计
2024-09-06
“交我算”助力反应分子模拟结合尺寸外推联系聚合机理和反应动力学研究
导读introduction 聚合反应是现代工业中生产塑料、纤维、橡胶和涂料的关键过程。相比涉及小有机分子的反应，聚合反应是多尺度的复杂化学反应体系，不仅决定于聚合机理，还受到高分子链构象的涨落、分子间相互作用势能以及大尺度凝聚相行为的共同
2024-09-06
“交我算”助力研发具有完整功能的水溶性膜蛋白
导读膜蛋白的人工设计研究对于药物设计具有重要意义。近日，上海交通大学生命科学技术学院陶飞研究员等与美国麻省理工学院科学家合作，以《通过QTY密码设计具有完整分子功能的水溶性跨膜受体激酶》（Design of a water-soluble
2024-09-06
“交我算”助力海洋学院李大玮课题组发表冰盖-气候反馈研究成果
导读地球南北两极的冰盖可以反映气候变化，冰盖的消融也影响附近海域的气候、生态，并产生全球影响。近日，上海交通大学海洋学院长聘教轨副教授李大玮在 Nature 杂志子刊 Nature Communications上，以第一兼通讯作者发
2024-09-06
“交我算”助力单靶点mRNA肿瘤疫苗新进展
►►►导读mRNA疫苗在新冠疫情之后受到了全世界范围内的广泛关注，mRNA 疫苗的应用不仅限于传染病，还扩展到了更广泛的领域，如癌症和罕见遗传疾病。此前国外已经有研究证明多靶点个性化mRNA肿瘤疫苗安全性和初步疗效，以及术后患者的个性化mR
2024-09-06
“交我算”助力洪亮课题组联合发布FSFP：基于语言模型的蛋白质功能小样本预测方法
导读酶工程或者蛋白质工程是要对蛋白质做突变并筛选得到性质更优的蛋白质产品。传统的湿实验方法是类似于贪婪算法式的搜索方法，需要进行多轮实验迭代并反复进行实验验证，耗费大量的人力和时间。近日，上海交通大学自然科学研究院/物理天文学院/张江高研院
2024-09-06
“交我算”助力开发快速准确的空间可变基因（SVG）鉴定新方法
导读空间变异基因（SVG）的识别对于通过空间转录组学来理解疾病的时空特征和组织结构非常重要。近期，上海交通大学生命科学技术学院/医学院临床研究中心俞章盛教授课题组与合作者在《Nature Communications》在线发表“HEARTS
2024-09-06
“交我算”助力高选择性尿素氧化耦合高效制氢
导读电化学尿素氧化作为处理富尿素污水并实现资源化的重要策略备受关注。在该过程中，阳极氧化尿素至N2实现污水脱氮，阴极分解水实现节能制氢。然而，传统的Ni基电极尿素氧化面临选择性差的挑战，解决该问题的关键在于如何设计和发展新型电极。近日，上海
2024-09-06
“交我算”助力综合可变剪接分析揭示B细胞急性淋巴细胞白血病的新预后特征
导读急性淋巴细胞白血病（ALL）是一种进行性血液恶性肿瘤，由造血组织和淋巴组织，尤其是骨髓、脾脏和淋巴结中的淋巴细胞失控增殖引起。替代剪接（AS）失调是 B 细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）发病、进展和耐药性的关键因素。尽管其意义重大，
2024-09-06
"交我算"助力中国心脏代谢疾病和癌症队列研究
导读在全国范围内估计常见的可改变风险因素对死亡率的影响仍然至关重要。在中国，有针对性的卫生干预措施对于有效降低死亡风险至关重要。2024年7月26日，上海交通大学医学院附属瑞金医院王卫庆及毕宇芳共同通讯在《Cell Reports Medi
2024-09-06
“交我算”助力邓子新团队揭示聚酮合酶的C-N键形成机制
导读聚酮合酶（PKSs）是自然界中一系列强大的多功能酶，能够合成具有广泛生物活性的天然产物，包括：抗生素，降胆固醇药，抗肿瘤药以及免疫抑制剂。由于其具有功能多样、结构复杂等特点，探究PKSs的基本催化机制一直是微生物天然产物合成，进而衍生新
2024-03-07